Per seguire i problemi specifici dei vari comparti produttivi, sono istituite delle Sezioni di Prodotto, composte e presiedute dai Produttori che operano negli specifici settori. Le Sezioni di Prodotto hanno la finalità di svolgere indagini, porre analisi ed elaborare le proposte che Confagricoltura Foggia fa proprie e tende a concretizzare.
Le sezioni di prodotto sono: